"A Igreja e Convento de São Francisco de Tavira, é um imóvel fundado por D. Dinis nos finais do séc.XIII ou inícios do XIV. Terá sido erguido sobre antigas construções islâmicas, e ocupado posteriormente pelos franciscanos.
Da época da sua fundação e dos seus primeiros fundadores, nada se sabe com certeza, nadando os cronistas num mar de dúvidas. É certo porém, que tendo sido conquistada Tavira em 1242, e ficando o domínio do Algarve de todo na posse dos cristãos em 1252, só depois destas datas poderia ali ser fundado qualquer cenóbio.
Compunha-se o cenóbio de casa própria, com seu largo e espaçoso claustro, e de uma grande Igreja em forma de cruz, grandeza e forma que atestava não só a sua ancianidade, mas o poder de quem o fundara.
No início do século XVI, localiza-se na Igreja a confraria que daria origem à Santa Casa da Misericórdia, juntamente com confrarias que dispunham de capela privativa, como as de Nossa Senhor da Boa Morte, de Santo António e da Ordem Terceira de São Francisco ou da Penitência.
No reinado de D. Manuel I, o Convento é ocupado pelos Religiosos Observantes. Achava-se então, a porta principal da igreja voltada a ocidente. A capela-mor, no lado oposto, tinha ainda em 1579 nos boceis dos seus artesões as quinas portuguesas e a esfera, divisa de D. Manuel, que ali as mandara colocar em 1517, quando reformou a casa. Compunha-se a capela-mor, grande e abobadada, dum altar central tendo ao meio da tribuna a imagem da Senhora da Conceição, que fora trazida de Tanger por António Correia da França, fornando-lhe irmandade de gente nobre.
Em 1755, a Igreja e o Convento sofrem graves danos com o terramoto.
Em 1834, com a extinção das Ordens Religiosas, dá-se a nacionalização dos bens do Convento, à excepção dos bens das Confrarias. A Câmara adquire então parte da cerca pegada à Igreja para nela implantar o cemitério em substituição do localizado no Castelo.A partir de então aquele espaço foi alvo de muitas alterações, resultando num edifício complexo devido às numerosas transformações e adaptações que sofreu ao longo dos anos.
Em 1881, escrevia Damião de Vasconcelos num artigo intitulado "Notícias Históricas de Tavira", publicado na Revista O Ocidente: "No ponto mais elevado da cidade de Tavira, junto e fora da sua antiga cerca, em um sítio aprazível e desafogado, está situado o que foi antigamente O Convento de São Francisco de Tavira, de frades xabreganos, e o mais antigo do Algarve".
In Plano de Reabilitação e Salvaguarda do Centro Histórico de Tavira, da autoria de Carlos Duarte e José Lamas, Ldª, 1985

Anúncio n.º 282/2020, DR, 2.ª série, n.º 248, de 23-12-2020 (ver Anúncio)
Despacho de 19-10-2020 do subdiretor-geral da DGPC a determinar a abertura do procedimento de classificação de âmbito nacional
Proposta de 17-08-2020 da DRC do Algarve a propor a abertura de procedimento de clasificação de âmbito nacional