Em c. 1514, D. Jaime, IV Duque de Bragança, que então habitava o paço de Vila Viçosa, mandou fundar um convento destinado a Panteão das Senhoras da sua Casa, e igualmente a receber as suas filhas solteiras. O Real Convento das Chagas de Cristo foi terminado em 1533, no tempo de seu filho D. Teodósio, V Duque.
A igreja, de estilo renascença, possui fachadas contrafortadas e portal apilastrado em mármore da região. O claustro clássico, datado do reinado de D. João III, tem dois pisos vazados por arcarias geminadas. Á volta do claustro, para onde deitam várias capelas, desenvolvem-se as dependências conventuais. A igreja, de nave única, é revestida por azulejos datados de 1626. A abóbada é decorada com pinturas a fresco. A capela-mor, coberta por abóbada estrelada, possui um retábulo é de estilo nacional, da época de D. João V.
O edifício conventual foi adaptado à hotelaria, nele funcionando a Pousada D. João IV. SML

Decreto n.º 33 587, DG, I Série, n.º 63, de 27-03-1944 (Igreja e Claustro)(ver Decreto)